Avec des unités d'endocrinologie, de cardiologie, de pneumologie, de néphrologie, de gastroentérologie et le suivi des maladies chroniques (diabètes, AVC, drépanocytose, etc). Il possède 19 lits d'hospitalisation et 3 cabinets de consultations. Le service de médecine interne est appuyé par un centre d'excellence dans la prise en charge de la tuberculose, du VIH et d'autres comorbidités (Monkole 3).